近日，郭志云团队在国际生物信息领域权威期刊《Molecular Biology and Evolution》发表了题为“EnhancerDB 2.0: a comprehensive cross-species enhancer atlas”的研究论文。本研究通过开发EnhancerDB 2.0平台，在原有数据库基础上大幅扩展物种覆盖、丰富多维度注释信息并整合功能分析模块，系统构建了更全面且可持续更新的增强子综合资源，填补了现有数据库在跨物种兼容性和深度调控解析方面的不足。

增强子是基因组中进化上高度保守的顺式调控元件，能够驱动时空特异性基因表达程序，在生物体的发育、物种适应及表型多样性中发挥着关键作用。增强子的异常调控与多种疾病的发生密切相关，因此建立系统全面的增强子数据库对于阐明其生物学功能和调控网络具有重要意义。然而，现有增强子数据库普遍存在物种覆盖有限、注释维度单一、功能分析模块缺乏以及缺乏持续维护等问题，难以满足日益增长的多物种、多组学研究需求。为此，郭志云课题组在原有 EnhancerDB 1.0 的基础上，开发了全面升级的 EnhancerDB 2.0平台。

EnhancerDB 2.0 在物种覆盖、数据规模和注释深度上均实现了大幅提升。物种方面，数据库从 EnhancerDB 1.0 仅覆盖人类扩展至五个物种（人类、小鼠、斑马鱼、果蝇和酵母），增强子条目总数达 1,605,856 个，较上一版本新增约 110 万条。未来，团队将继续整合新发表的实验验证增强子数据，进一步扩展可视化与分析模块，并欢迎研究人员提交自有增强子数据以共同丰富数据库内容。EnhancerDB 2.0 现已公开访问，用户无需注册即可直接下载数据资源。

数据库访问地址：//lcbb.xinmacaulhc.com/enhancerDB2.0/

论文链接：//academic.oup.com/mbe/article/43/7/msag161/8735116

郑均诺为论文第一作者，李雨坤和杜星仪分别为第二、第三作者，郭志云老师为通讯作者，西南交通大学为第一通讯单位。

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